Un estudio revela el primer genoma de un crustáceo de aguas profundas

El ambiente de las profundidades marinas se caracteriza por la oscuridad, las bajas temperaturas, la alta presión hidrostática y la falta de alimentos. A pesar del entorno hostil, se ha identificado un número cada vez mayor de animales que viven en las profundidades de este ecosistema, incluidos gusanos, moluscos, peces y crustáceos.

Muchos genomas, incluidos los de gusanos tubícolas, moluscos y peces, se han publicado en los últimos años, mientras que ninguno crustáceo el genoma ha sido reportado.

Recientemente, un equipo de investigación dirigido por los profesores Li Fuhua y Li Xinzheng del Instituto de Oceanología de la Academia de Ciencias de China (IOCAS) informó sobre el primer genoma de crustáceos de aguas profundas e ilustró los mecanismos relacionados con el gigantismo corporal de los isópodos de aguas profundas. y mecanismos específicos para mariscos adaptarse a ambientes profundos.

El estudio fue publicado en Biología BMC Mayo 13.

Los investigadores han secuenciado y ensamblado un genoma de alta calidad de un isópodo gigante (Bathynomus jamesi), que no solo tiene un gran tamaño corporal, sino también un tamaño de genoma grande (el más grande entre los crustáceos secuenciados), los cuales parecen dos estrechamente asociados con su adaptación a alta mar medio ambiente.

A diferencia de sus parientes de baja estatura, las vías relacionadas con el crecimiento en B. jamesi se enriquecen principalmente con familias de genes extendidas, incluidas dos vías de señalización hormonal (tiroides e insulina). Forman una red mejorada de genes relacionados con el crecimiento y, por lo tanto, contribuyen potencialmente al gigantismo del cuerpo.

Para adaptarse al entorno oligotrófico de aguas profundas, B. jamesi tiene una tasa metabólica basal baja, almacenamiento y expansión de alimentos a granel. familias de genes relacionados con la utilización de nutrientes. “El cuerpo graso bien desarrollado de B. jamesi se usa para almacenar reservas orgánicas, y nuestros resultados indican que el acumulación de lípidos en el cuerpo graso debería ser el resultado de una baja eficiencia en la degradación de lípidos en lugar de una alta eficiencia en la síntesis de lípidos”, dijo Yuan Jianbo, primer autor del estudio.

El genoma de B. jamesi puede ayudarnos a comprender la historia evolutiva y migratoria (entre el fondo profundo y el fondo poco profundo y la tierra) de los isópodos e incluso de los crustáceos. “Este genoma también nos ayuda a comprender la genética relacionada con el gigantismo corporal y a descubrir la misteriosa genética relacionada con su estado de ayuno extraordinariamente largo, es decir, 5 años de inanición, y los mecanismos de adaptación específicos de los crustáceos. . [to] ambientes de aguas profundas”, dijo Yuan.