Científicos japoneses están adoptando un nuevo enfoque para estudiar las poblaciones de estrellas de mar en aguas profundas
3 min readPor primera vez, los investigadores están desarrollando una tecnología de metacodificación de barras para estrellas de mar. Científicos japoneses, dirigidos por el Dr. Masanori Okanishi de la Universidad Hiroshima Shudo y la Universidad de Tokio, analizaron el ADN ambiental (eDNA) liberado por los invertebrados marinos en el agua e identificaron con éxito las especies que buscaban. El estudio se publica en Metabarcode y metagenómica.
Los metabarcodes permiten a los investigadores identificar especies de manera fácil y rápida y determinar su número en un lugar determinado en función del ADN ambiental (es decir, el ADN liberado, por ejemplo, en el agua de un lago en particular).
En Japón, este método se ha utilizado con éxito para detectar el número de especies en lugares específicos del mar muestreando tan solo un balde de agua. El monitoreo de especies es parte del esfuerzo por conservar los recursos biológicos y mantener su valor económico, y el código de barras meta se puede utilizar como una herramienta menos laboriosa y más rentable para los estudios de biodiversidad marina.
El nuevo estudio informa sobre el desarrollo del equipo de investigación de los primeros cebadores de ADN para la metacodificación de barras de estrellas de mar. Las estrellas frágiles son las especies más abundantes del filo de los equinodermos (aproximadamente 2100 especies), lo que las convierte en organismos indicadores prometedores para la codificación de metabarras del ADN ambiental. Se cree que estos invertebrados marinos liberan abundante ADN ambiental debido a su tamaño, grandes poblaciones y hábitats en una variedad de entornos de fondos marinos.
Para determinar el origen de las secuencias de ADN obtenidas de las muestras y utilizadas para la metacodificación de barras, el equipo de Okanishi construyó una base de datos de secuencias de ADN de referencia basada en especímenes identificados para 60 especies de estrellas frágiles de la bahía de Sagami.
Hasta ahora, el metabarcode no se usaba para organismos de baja motilidad, como las estrellas de mar, porque muchas secuencias de ADN de referencia se habían identificado erróneamente o no se habían identificado. La nueva base de datos facilitará la investigación y la aplicación de la tecnología.
“Si el metabarcode se vuelve posible a través del desarrollo de cebadores adicionales y bases de datos más ricas de secuencias de ADN de referencia, será posible monitorear el ambiente marino con una precisión nunca antes imaginada”, afirman los autores.
Más información:
Masanori Okanishi et al, Desarrollo de dos nuevos conjuntos de cebadores de PCR para la codificación de metabarras de eDNA de estrellas de mar (Echinodermata, Ophiuroidea), Metabarcode y metagenómica (2023). DOI: 10.3897/mbmg.7.94298
“Increíble aficionado a la música. Estudiante. Empollón empedernido del café. Jugador. Especialista web aficionado. Pionero malvado de la cultura pop”.